生态水文实验中心是南京水利科学研究院实验中心和水文水资源与水利工程科学国家重点实验室的重要组成部分。中心建  于2009年，2012年投入试  运行，面积约2173m2。主  要开展水文、水生态及水  环境方向的检测分析和实  验研究。  

 已进行的科研项目

生态水文实验中心试运行以来，承担了水专项、水利部公益性行业科研专项、国家重点实验室基金、院基金以及其他科研项目的分析检测和实验工作。   

 主要研究项目：

  1、淮河水专项”淮河流域典型水域（洪泽湖以上）水生态系统生态演变及其与水文过程关系研究”；

  2、水专项“太湖流域重大工程生态影响监控与评估”；

3、水利部公益性行业科研专项“基于水文实验流域的污染物迁移规律研究”；

 4、国家重点实验室基金“受损水体生态修复技术应用与监测研究”。